1997年，新加坡政府首次提出建立新加坡管理大学的构想。大学体制参照美国大学的模式，以自主、开放为特征。自1999年起，新大商学院与美国宾夕法尼亚大学华顿商学院合作，并建立了联合研究中心。2000年，新大的首个校舍投入运作。该址曾是创立于1929年的莱佛士学院（Raffles College）和后来的新加坡国立大学（National University of Singapore）之所在地，邻近华侨中学（Hwa Chong Institution）。2001年，校方开展校舍改善工程，并保留了殖民地时期的建筑风格。在2001年至2004年间， Ronald Frank教授出任大学校长，其后由Howard Hunter教授接任。现任校长为Arnoud De Meyer，在2010年9月就任。2005年，新大正式迁入勿拉士巴沙(Bras Basah)的永久校园，并举行了首届毕业典礼。其后，校方将经济与社会科学院拆分为经济学院和社会科学院。同年，新加坡教育部将新大与新加坡国立大学及南洋理工大学改制为自治大学。2011年4月，新加坡管理大学获得国际商管学院促进协会的商学及会计认证。

科研成果：自1989年至今，全港获得国家科学技术奖（其中之国家自然科学奖、国家科学技术进步奖、国家技术发明奖）的55位卓越科学家中有15位为港大成员，他们共获颁17个奖项。获奖人数为受香港大学教育资助委员会（教资会）资助院校之冠。其中一位成员为首位获颁国家自然科学奖一等奖的香港科学家。